sten8509 Что менялось за время между обвалами? Были проблемы? Не было никаких косяков, с доступам к отдельным страницам сайта? Уведомлений в инструментах вебмастера или на почту никаких не падало? Возможно
после очередной переидексации, поисковик мог счесть главную страницу наиболее релевантной соответствующим запросам (может ссылок купили не на те страницы или проспамили запросы с ссылкой на главную). Не глядя и не зная ситуации, сложно со стопроцентной точностью ответить в чем дело. Пробуйте обратиться в саппорт гугла или яндекса (если Вы пишите о обвале в них), там Вам могут помочь выяснить в чем дело. Также не исключены ошибки со стороны ПС (такое бывает очень редко, но тоже не исключено) или потери связанные с изменениями алгоритмов ранжирования.