Электронная бухгалтерия бухгалтера не заменит. Она лишь частично автоматизирует всякую нудятину, но объем работы при этом не сильно уменьшается.
Моё дело, эльба — их основная функция документы рисовать. Для интернет-магазина это намного проще и удобнее делать средствами CMS магазина! Т.е. половина функций Вам просто не нужна. Смотреть что и когда сдавать, консультироваться можно например на
клерке. Со временем наймете бухгалтера или отдадите на аутсорсинг.
Я пользуюсь «моим делом», но мне многого не хватает. Финансового модуля например. Или шаблонов документов, удобных фильтров. Несколько раз натыкался на косяки, когда по логике и законодательству надо что-то сделать, а их интерфейс это не позволяет. Электронной отчетностью пока не пользовался — но для ООО это будет более актуально. Попробуйте насколько удобны будут Вам эти системы, сколько функций востребовано будет.
Финансовый учет виду в экселе, приходится сверять с «Моим делом». Альтернатива — поставить 1С, о чем раздумываю периодически.