Ну, восстановите из бэкапов да и всё. А так делайте в другой раз как я. Я прописываю в конфиге моего виртуалхоста
include conf.d/my_ip.inc;
Там у меня разрешеные айпишники.
Потом:
location / {
if ($remote_addr = $my_ip)
{
set $root_path $root_path/new_papka; #указываем путь до папки где разрабатываем и где не надо чтоб видели
}
И всё. Пользователи видят заглушку которую поставил я, ну а сам разрабатываю себе на здоровье и никто не видит.