Мануалы
Яндекса или
Гугла не имеют информации о том, чтобы ставить rel="nofollow" на дублирующие ссылки.
Такой информации нет даже на странице Гугла, посвященной дублирующему контенту. Кроме того,
есть информация, nofollow - это плохо. Но сам Гугл говорит, что
это не так, что единичные nofollow-ссылки ни на что не повлияют и просто будут исключены из графа ссылок. Общим является то, что нигде нет информации о том, чтобы помечать дублирующиеся ссылки атрибутом rel="nofollow", но есть немало информации о том (
например), что гугл берет только первую ссылку, что nofollow для внутренних дублирующихся ссылок не нужен, но если поставить, то ничего не случится. Думаю, Яндекс поступает как-то аналогично, потому что это, во-первых, логично, а во-вторых, от него я не встречал иной информации.
Отсюда вывод, что nofollow нужен для контента, к которому нет доверия, но не чтобы дублирующие ссылки. Это его изначальное предназначение. Кроме того, этот атрибут ближе к рекомендации, чем к приказу.
Так что делайте сколько угодно внутренних ссылок у себя на сайте. Все равно гораздо важнее общее качество контента и общее качество сайта (структура, верстка, URL и т.п.).
Что касается перелинковки, то ее делать нужно логично/правильно, чтобы вы сами хотели по этим ссылкам нажимать, это было удобно. Вы говорите, что "не должно быть ссылок на страницы, которые находятся уровнем выше" - это почему? Они могут быть, их может быть много. Взять каталог, у которого есть путь, - вот вам ссылки выше по уровню.
