Если количество строк-цифр в обоих файлах не превышает размер листа Excel, то можно просто скопировать оба файла в один столбец в Excel друг за другом, выделить этот столбец и выполнить Data -> Remove Duplicates.
На всплывшем окошке вам скажет сколько дублирующихся записей было удалено, это и будет кол-во совпавших номеров.