Во-первых, вам придется выбрать между собственной платой и линуксом
Дело в том, что для того, чтобы линукс работал без костылей, нужен контроллер с поддержкой
MMU. По факту это означает, что вам нужен
Arm Corttex A. Но это довольно сложные контроллеры, предполагающие сложную обвязку, и - что самое главное - большое количество ног. Даже если вам удастся отловить исчезающий вид Cortex
A не в
BGA корпусе, который просто невозможно распаять без опыта и специального оборудования в домашних условиях, то у вас будут очень большие проблемы с изготовлением платы и ее пайкой без паяльной станции, которая стоит не таких уж и маленьких денег (если для BGA нужно
хотя бы что-то
такое, то и обычные бескорпусные элементы паять без станции очень неудобно)
На самом деле разработчики оборудования такого класса почти всегда используют developer boards, которых существует
огромное количество под
всякие разные применения и совершенно различных стоимостей. К такого класса платам относится и Raspberry Pi, но уже точно не Arduino.
С другой стороны, вы можете взять готовую отладочную плату, и подключить к ней дополнительные модули, используя всю ту же
макетную плату для коммутации - возможно, это именно то, что вам хочется)
Если вам важнее пособирать что-нибудь самому, то нужно ориентироваться на Atmel
AVR (или
PIC?) контроллеры в
DIP корпусах. Такие контроллеры все же удобнее прототипировать на
макетных платах (
с дырочками! кстати, удобно и бюджетно), а готовые решения уже можно пытаться изготавливать с использованием метода
ЛУТ и советского паяльника для проведения криптоанализа.
Вообще, конечно - электроника довольно сложное дело, если делать все руками. Поэтому и были разработаны Arduino и Raspbery PI, с набором совместимых компонентов, которые можно друг в друга воткнуть. С них и стоит начать - на ваш выбор Raspbery PI с Linux,
STM Discovery как продвинутый ARM без операционки, и Arduino.
Если понравится, изучайте архитектуру процессоров с точки зрения программиста и схемотехнику с точки зрения разработки электронной начинки
