Боюсь, вопрос ваш таит больше, чем вы хотите услышать.
По умолчанию в Linux система доступа - это DAC.
https://ru.wikipedia.org/wiki/%C8%E7%E1%E8%F0%E0%F...
В вашем случае нужно дать права на эту папку этому пользователю:
chown user:group /usr1
.
И назначить возможность ее изменять/читать:
chmod 700 /usr1
В таком случае группа не сможет читать/писать туда, как и все остальные, но пользователь сможет. Однако данный пользователь сможет получить доступ к любым другим ресурсам, если там стоят соответствующие права.
В вашем же случае, обращая внимание на постановку вопроса и на название директории (usr1), скорее всего, вы хотите сделать что-то странное и не тем инструментом. Возможно, стоит почитать про SELinux, возможно, вам поможет chroot (небезопасен в определенных случаях), возможно, нужно посмотреть в сторону cgroups/LXC или виртуализации.
Напишите, что хотите сделать. :)