Штатно вряд ли, но сначала попробуй: в acme-резолвере Traefik задай свой caServer,
https://nuc-acme.voskhod.ru/acme/api/v1/directory, и обычный httpChallenge — lego внутри Traefik ходит на любой ACME-сервер. Проблема скорее в другом: Traefik не даёт настроить поля CSR вроде C=RU, которые НУЦ, похоже, и требует, отсюда патченный acme.sh. Если упрёшься именно в это, форкать Traefik не обязательно: гоняй сертификат отдельным скриптом НУЦ по крону, а Traefik пусть подхватывает готовые cert/key через file provider. Публичного staging-эндпоинта не видно, только прод, тестируй на некритичном поддомене.