@Kimely храните свой криптоконтейнер на съемном носителе или на отдельном разделе и в случае необходимости запускайте фоном какую-нибудь утилиту для вайпа с дальнейшей перезаписью. мб Вам что-то типа этого подойдет.
@Kimely для них не нужно что-то специфичное, общие методы удаления и перезаписи работают с любыми данными. Для надежности можете криптоконтейнер на шифрованном диске хранить и можете быть спокойны за свои данные (если используете надежные ключи!).