В любом автоматизаторе - запускаете приложение свёрнутым, получаете хэндл окна, далее окно в трей отправить. Чисто технически это работает следующим образом: окно прячется, через WinAPI в трей добавляется иконка, а на клик по иконке вешается коллбэк по восстановлению окна.
Пример для nnCron: https://nncron.ru/help/RU/working/plugins/win2tray...
Есть утилита rbtray, прячет по клику правой кнопкой, исходники примитивные, можно подправить что бы делала она это для всех окон в системе из командной строки
так она чтото не работает. и видимо нужно нажимать, а я хочу чтобы сразу в трей сворачивалось как делает команда описаная в после, только она сворачивает в панель задач то что не сворачивается в трей само, но в трей при нажатии сворачивается эта прога, изза которой и написал пост, она конечно не одна