Хм. Взять пакеты от epel, за которые вообще говоря Oracle не отвечает - а потом жаловаться, что конфликт зависимостей - очень умное решение.
Вы уж либо "крестик снимите", то есть найдите пакеты, зависимости которых не найдены, тем более, что они прям перечислены (у меня в EL6 была прописана пачка репов, кроме epel - elgis, remi, rpmforge, rpmfusion, lux, wandisco - не знаю, кто из них сейчас жив, давно отошел от темы EL) либо "трусы оденьте" - то есть уберите epel и используйте только оракловые репы, тем более, что X должно быть в базовой поставке.