syncting или rsync (если подойдет ручное управление) и git (не смешивая их).
syncting хорошо работает с большими данными и любыми схемами передачи данных (вплоть до источник -> смартфон пользователя offline, смартфон -> целевая машина, и так же обратно, т.е. без интернета)
git - дисциплинирует ставить 'точки в правильных местах', т.е. вы работаете не абы как а до commit-а, даже если вы один работаете, это дает вам историю изменений, которая может и нужна очень редко, но метко.
