Такая проблема: Пробую для себя вебшторм и столкнулся с проблемой уже 2-й раз. В какой-то момент, возможно когда кто-то сливает мерж реквесты, у меня в вебшторме, при update, все файлы проекта попадают в changes. Как это можно вылечить?
Права доступа гит не хранит.
А вот когда кто-то поменял концы строк, то такое может произойти.
Согласуйте в команде этот момент, чтобы каждый раз не чинить.