но у меня есть лишь одно доменное имя
Имея доменное имя, обычно, можно создать сколько угодно поддоменов.
например, на одном поднять базу данных, на втором и третьем веб-приложение и микросервисы
Сертификат тебе нужен только в одном случае - если ты делаешь публично доступный по Https сайт или сервис.
Если ты делаешь сервис только для других своих сервисов, то можешь использовать самоподписанные сертификаты.
Если ты общаешься не по Https (как в случае с базой данных", то тебе Https-сертификат тоже не нужен. (Если база данных поддерживает TLS, то можно тоже воспользоваться самоподписанным)