Анализируешь окно приложения на состав win32 окон ( там может быть сложная иерархия, вплоть по контрола или одно основное, а интерфейс рисуется) с помощью штатной утилиты microsoft visual studio spy++, затем в программе ищешь по выявлненным свойствам окно
FindWindow и шлёшь сообщение с помощью
SendMessage. С помощью spy++ можно проанализировать какие именно сообщения приходят при клике.
P.s. Для directx приложений это не сработает