1) На толщину слоя пыли, которым покрыт кулер ЦПУ и компоненты около него.
2) После выключения попробуйте на ощупь установить температуру крышки системного блока и блока питания. Программа CPU-Z вроде показывает температуру. Если на процессоре все ок, но блок питания горячий, попробуйте почистить. Если нет, то дальнейшую диагностику лучше проводить человеку с опытом.
Щелчек может быть вызван много чем. Механические компонентов типа cd-привода, кулеры на проце/бп/видео, в самом бп может щелкать, особенности мат. платы.