Если честно, отдельный backup реестра в современных Windows - уже довольно сомнительная история и скорее пережиток времён XP/7.
Когда система ломается настолько, что не грузится, проблема обычно уже не только в реестре: драйверы, обновления, BCD, WinSxS, файловая система и т.д.
Да, backup hive-файлов (`System32\Config`) технически намного правильнее, чем экспорт в `.reg`, и восстановить их действительно можно. Но на практике это уже скорее аварийная низкоуровневая возня, чем нормальная стратегия backup’ов.
Штатное восстановление Windows тоже исторически не самая надёжная вещь — особенно после опыта XP/ранних Win7 многие на него забили. Поэтому если система реально важна, то обычно делают полноценные image/snapshot-бэкапы через VSS (Macrium, Veeam, Acronis и т.п.), а не пытаются отдельно спасать реестр.