Я так понял вопрос у вас из-за того что в html-файлах вашего архива ссылки ссылаются на VK.
Я, честно говоря, ни разу не видел какого формата архив выдаёт контач в таких случаях, но предположу, что там каждому объекту со ссылкой (сообщение, фото, etc) соответствует файл. В таком случае вам вероятно следует заменить каким-нибудь редактором во всех href у ссылок этого архива путь с домена ("Ссылка удалена модератором. " или что там у них щяс) на локальный. Тут правда есть нюансы, что в таком случае надо было бы как-то отличать ссылки на ваши сообщения (которые теперь будут локальные) и на чужие, которые после удаления вашего аккаунта останутся доступными, а значит их не надо менять.
Но это только предположение. Без конкретного примера сложно делать предположения. Если хотите чтоб вам помогли советую выложить как пример пару файлов.