Нужно было один раз выполнить импорт всех товаров независимо от того, менялись они или нет, для заполнения определенного свойства значением, приходящим со склада. Так как такой импорт нужно было сделать только один раз, прибег к изменению файлов ядра (которые потом отменил). Если кому-нибудь будет нужно, объясняю, как сделал.
/bitrix/modules/iblock/classes/general/cml2.php
Строка 2973:
if($bMatch && $this->use_crc)
Здесь производится проверка контрольной суммы, а в "else" после этого блока - как раз действия, выполняемые, если товар был изменен. Нужно отключить этот блок, самый простой способ:
if($bMatch && $this->use_crc && false)
Тогда все товары будут импортироваться, даже если они не были изменены. Только после импорта изменения необходимо отменить - менять файлы ядра запрещено.