Сейчас более актуально управление из powershell. По крайней мере сама микрософт сейчас активно posh продвигает.
В cmd из коробки можно управлять много чем. Многие настройки винды лежат в реестре, а реестр править из cmd можно, правда применять большую часть настроек, внесенных правкой реестра на прямую, придется перезагрузкой компа.
Выключить и перезагрузить комп можно командой shutdown.