Добрый день. Уже несколько раз встречал такую проблему, что оплата заказа через Qiwi кошелек проходит, деньги на кошелек начисляются, а статус заказа на сайте остается "не оплачен". Так же на почту не приходит письмо о том что оплата произведена через Qiwi кошелек.
Настройки в магазине и на сайте произведены согласно инструкции:
1. Создаем пару ключей по API (публичный ключ нам не понадобится)
копируем с сайта URL уведомлений
2. Собственно вставляем секретный ключ на сайт
3. Берем переменную, без кавычек, ту что выделена черным, ставляем на сайт