По инструкции галочку попробуйте снять:
"Внимание!
Интеграция со СДЭК переходит на версию 2.0. Если функционал модуля перестал работать - необходимо в сервисных свойствах (щелчок по заголовку) убрать флаг "Использовать старый API для запросов" для перехода на новое API. Функционал будет дорабатываться - следите за обновлениями. Рекомендуется временно не использовать события модуля. Учтите, что базы данных старого и нового API различы.
Приносим извинения за временные неудобства."
На этой странице внизу (вкладка настроек)
/bitrix/admin/settings.php?lang=ru&mid=ipol.sdek&mid_menu=1