Если осознать, что докер — это
НЕ ВИРТУАЛИЗАЦИЯ, как многие умники тут пишут, то всё звучит не так страшно. Докер контейнер исполняется на той же хостовой машине, задача докера — изоляция фс и сетевого стека. Производительность контейнеров
nearly identical to native (это ровно то, чем поделился
Дмитрий) за исключением сетевого стека, если не выбираешь полностью хостовый network.
Однако, если твоё приложение на одной тачке не пытается обслужить десятки или сотни тысяч запросов в секунду, то абсолютно без разницы, в докере оно или нет.