Берём какую-нибудь одну картинку, запускаем запись Action, делаем всё необходимое включая сохранение, выключаем запись Action, закрываем картинку.
Потом идём в File -> Automate -> Batch, выбираем папку с 1000 изображений, наш Action, ставим галку на Override Action "Save As" command, остальные настройки и готово дело.
И бэкап исходников сначала стоит сделать, на всякий.