MaxKozlov вы читали что там написано то? по ссылке надокументацию не рекомендуется использовать sqlite
SQLite runs in memory, and backs up its data store in files on disk. While this strategy works well for development, Heroku’s Cedar stack has an ephemeral filesystem. You can write to it, and you can read from it, but the contents will be cleared periodically. If you were to use SQLite on Heroku, you would lose your entire database at least once every 24 hours.
резервную копию sqlite нужно делать ее штатными средствами, методы есть практически во всех драйверах для популярных языков, например для php или python