Неужели нет нормальной программы для такого часто выполняющегося действия?
Оу... Часто - это раз в год?
Вообще, такая операция как перенос с одного диска на другой требует понимания что и как в системе работает. В линуксе есть такая универсальная штука - называется
dd. Но это не то что вы ищете.