Вот
описание вариантов указания времени в FFMPEG. В том числе:
[-][HH:]MM:SS[.m...]
— ваш вариант, вполне легитимный.
Но видео это последовательность отдельных кадров, и, в зависимости от кодека, не ко всем из них можно подрулить — только к «ключевым». Там может быть один ключевой кадр, скажем, на 8. Полной картинкой записывается кадр, а следующие 7 — это только diff'ы, изменения относительно ключевого.
Как вариант, попробуйте ещё указать то же время в ms:
-ss 2208ms