У меня linux mint, шторм установлен в ручную через архив.
При открытии вкладки
Commit там пусто, говорит либо иницилизируйте git либо подключите.
В проекте есть папка .git
Из консоли если написать git status всё там работает и видно.
Так же если в шторме открыть через верхнюю панельку:
Git -> Uncommited Changes -> Show shelf и там вкладка Local Changes то там будет примерно похожая картина как должна быть в Commit вкладке на тулбаре.
Что могло пойти не так ?