1C? -универсально, можно под что угодно допилить.
Можно УНФку, для оперативного учета всего. Можно попробовать в Бухгалтерии все делать.
eoffice.su/services/303 - 1Ска (УНФка / Бухгалтерия)
eoffice.su/services/301 - 1Ска (Бухгалтерия) + бухгалтерский аутсорс от 1С
Я у себя в аптеке использую УНФку. Для стоматологии
dental-soft.ru - вот такое решение. При должной сноровке можно и Дентал-софт для аптеки использовать, складской модуль + кассовый, правда не знаю, получится ли как к 1Ске прикрутить сканер штрихкодов.
Сверху, что бы с бухгалтерией заморочек не было использую сервис аутсорса бухгалтерии.