Сначала появляется тэг к которому применяется скрипт на секунду и только потом срабатывает. Я уже подключал и вверху страницы и внизу и внутрь html ставил и все равно задержка. Что может быть? Это не дает спать.
1) Возможно тормоза.
Отпрофилируйте в гугл хроме, узнаете время выполнения вашей функции в скрипте.
2) Ожидает чего то... подгрузка, событие в следствие чего выполнение с задержкой.