А зачем?
Вы хотите это запушить? Тогда поменяется история для всех участников, и они все должны с этим согласиться и скачать новый вариант ветки с коммитами. Сможете синхронизировать эту активность для всех участников? (тут скорее всего самый простой вариант, что вы у себя удаляете этот коммит, например переделывая всю ветку через rebase или rebase со squash, а остальные участники удаляют у себя весь репозиторий и скачивают его с нуля).
Но зачем такое делать? Коммит в ветке просто показатель что в этом месте был мерж из другой ветки, и чтобы не было мерж коммитов по идее надо было во время мержа выбирать вариант