lssssssssssl, с точкой на конце доменное имя действительно не работает. На мой взгляд, это недоделка со стороны yandexcloud и об этом стоит написать им в поддержку.
Но, как я понимаю, вы создаёте запись CNAME, чтобы вместо поддомена yandexcloud.net использовать адрес в вашем домене, и он должен работать не смотря на точку. Более того, все записи CNAME, ведущие на сторонние домены, всегда завершаются точкой, даже если она не показывается в панели управления DNS.