AD тут вообще не при чём, лицензии активируются на сервере лицензий удалённого рабочего стола.
Устанавливаете на одном из серверов соответствующую роль, заходите в управление лицензиями, там активируете сервер лицензий и сами лицензии.
В настройках сервера удалённых рабочих столов (gpedit.msc, Административные шаблоны/Компоненты Windows/Службы удалённых рабочих столов/Узел сеансов удалённых рабочих столов/Лицензирование) указываете нужный тип лицензий (на пользователя или на устройство) и адрес сервера лицензирования.
Лицензии на пользователя выдаются на два месяца с автоматическим продлением.