Как правильно организовать структуру постоянно изменяющегося проекта?

Есть у нас веб-приложение которым пользуется пару сотен пользователей одной закрытой организации. Приложение громоздкое, с обширнейшим количеством функционала, часть которого мы сами уже не помним.
Схема работа приложения сильно завязана на законодательство, которое из года в год меняется.
Выходит вот что: написали какой-то фундаментальный класс, который использует другой класс и т.п. и всё это объединено в модуль. А через несколько месяцев говорят: логика работы поменялась, срочно переделать!
И приходится ломать всю структуру, зачастую костылями.

Вопрос: есть ли какие-то методологии разработки часто изменяющегося кода? Чтобы и нам просто было, и заказчику "срочно", как это всегда у него бывает