Имеет ли Keras инструменты для обучения без учителя?

.fit всего лишь запускает training loop, это не равносильно обучению с учителем. Хотя, справедливости ради, едва ли это лучший фреймворк для сложных алгоритмов unsupervised learning, т.к. API построено скорее больше под задачи обучения с учителем.