Как вариант:
добавить расширение вот это:
"nizsheanez/yii2-asset-converter": "1.*"
в конфиге:
'assetManager' => [
'converter'=> [
'class'=>'nizsheanez\assetConverter\Converter',
'destinationDir' => '', //at which folder of @webroot put compiled files
'parsers' => [
'less' => [ // file extension to parse
'class' => 'nizsheanez\assetConverter\Less',
'output' => 'css', // parsed output file type
'options' => [
'auto' => true, // optional options
]
]
]
]
],
в assets добавляем свой less файл и он конвертируется в css. Остается только вопрос как это все в bootstrap завязать. Видимо отключить его от yii и прописать его явно в виде less файлов.