Vladislav

Код, который работает некорректно...

Всё работает так, как и должно. После Object.freeze назначить новое свойство уже не получится. Можно записать итератор в прототип массива (ну и после того, как он отработает, вернуть оригинальный итератор на место):

const originalIterator = Array.prototype[Symbol.iterator];

Array.prototype[Symbol.iterator] = function() {
  let i = -1;

  return {
    next: () => (i += 2) < arr.length
      ? { done: false, value: this[i] }
      : { done: true },
  };
};

setTimeout(() => Array.prototype[Symbol.iterator] = originalIterator, 0);

Почему PhpStorm видит controller.php как обычный файл, а остальные — нормально?

Задай .new такую же ширину, как и у .new-content

Задай new-content максимальную ширину, как это делают для обычного container-класса, а лучше именно container класс и используй тут и внутри .new. Обычно именно так и делают.