Задача решилась следующим образом.
В каждую произвольную ссылку с якорем, я добавила свой класс. Далее через скрип удалила присвоение класса .current-menu-item - класс активного меню от самого WordPress и класс .act от используемой темы.
Далее, когда выбранный пункт меню становиться родительским, до возвращаем ему удаленный класс активного меню со стилями темы .act.
<script type="text/javascript">
jQuery(function($){
$(document).ready(function() {
$('#primary-menu li.disaster.current-menu-item').removeClass('current-menu-item');
});
$(document).ready(function() {
$('#primary-menu li.disaster.act').removeClass('act');
});
$(document).ready(function() {
$('#primary-menu li.disaster.current-menu-parent').addClass('act');
});
});
</script>