Никита //

Первый undefined, второй 1029384756
Если я конечно правильно понял суть задания!
Так же можно немного сократить код в циклах(как по мне), ну это уже на любителя

let userUrl = 'sss.sss.ru', phone_num_1, phone_num_2;
	let arr = [{
		site_id: "qwe",
		url: [ "eee.eee.ru", "www.www.ru" ],
		phone_num: "123456789",
		source: "qwe",
		ops: "velc"
	}, {
		site_id: "qwe_pc",
		url: [ "sss.sss.ru", "aaa.aaa.ru" ],
		phone_num: "1029384756",
		source: "qwe",
		ops: "mt"
	}];

	arr.forEach(function(item) {
		item.url.indexOf(userUrl) > -1 && item.ops == "velc" && (phone_num = item.phone_num);
		item.url.indexOf(userUrl) > -1 && item.ops == "mt"   && (phone_num_2 = item.phone_num);
	});

	console.log(phone_num_1);
	console.log(phone_num_2);

const formatPhone = n => (''+n).replace(/(\d{3})(\d{2})(\d{3})(\d{2})(\d{2})/, '$2 $3-$4-$5')