takoyklasnii

Есть система, на которой я могу создать магазин.

Прикрутить следующую часть:
1. ДНС сервер
2. Механизм выборки товаров в зависимости от домена

Если система изначально не проектировалась под подобные требования, то самое простое решение - смотреть какой домен запрошен и в зависимости от домена использовать свою БД и свои хранилища. Код будет везде один и тот же.