Александр

Вам нужно проверить адрес $wsdl = "https://192.168.333.3/LNetworkServer/LNetworkServi..."; он должен открываться в обычном браузере.
При помощи CURL вы отправляете конверт SOAP или просто делаете запрос GET/POST?
возможно вы формируете не верный конверт у себя, приведите фрагмент WSDL той функции к которой обращаетесь, и конверт SOAP который отправляете

укажите полное имя домена 2 и в конце поставьте точку

вероятно не верные данные хранятся в ROOT
физическое расположение скриптов у вас и у хостера отличается.

Крипто система довольно сложная вещь, включает в себя закрытый ключи и подписанные доверенным удостоверяющим центром открытые ключи. После накладывания подписи вы отправляете результирующий файл в котором сама информация и подпись или по отдельности информация + файл подписи, куда-либо. На приемной стороне снимают подпись на основе своей пары закрытый-открытый ключ (сертификат) и проверкой списка отзывов, который публикует удостоверяющий центр. Для обмена информацией точки обмена должны обменяться своими открытыми ключами, которые подписал данный удостоверяющий центр (это сертификаты). Закрытые ключи не должны покидать точки обмена.
Плагин для браузеров работает с самим криптопровайдером, и имеет свой API, с его помощью можно делать много чего, cpdn.cryptopro.ru/default.asp?url=content/cades/pl... скачайте библиотеку от производителя и там можно разобраться как это работает.
Для работы вам нужен либо сторонний УЦ, либо развернуть свой, установить корневой сертификат УЦ в доверенные на сервере и клиенте, выпустить 2 сертификата-ключа, для сервера и для клиента, на сервере установить сертификат клиента, на клиенте установить сертификат сервера, у клиента в личное хранилище установить свой сертификат.
Подписываете на клиенте, файл отправляете на сервер любым способом, там снимаете подпись, получаете исходный файл. Для всех манипуляций имеется ПО от производителя.

как сказали почту вы можете переносить без проблем путем настройки своего домена (ДНС), но стоит помнить, что обновление зоны может идти до 3-х дней, поэтому рекомендуется изменить настройки и начать переносить в пятницу вечером, что бы к понедельнику вы оказались на новом почтовом сервере. Думаю, что в выходные будет минимальное движение вашей почты. mx записи нужно сразу менять на новые.
Конечно вы всегда сможете получить почту со старых серверов (если имя сервера почты не связано с именем вашего домена), но как правило это вызывает сложности у обычных сотрудников.

фабрика нужна для создания самого объекта, при помощи фабрики в ваш объект или контроллер передаются в конструктор какие-либо параметры, либо другие объекты из сервис-менеджера/хранилища, причем при необходимости эти объекты так же автоматом будут созданы. В настройках вы говорите, что бы создать ваш объект нужно вызвать фабрику.
По второму вопросу - ZF3 может работать как middleware и как классический MVC. Для пакета Album и аналогичных нужно так же его прописать в файле modules.config.php что бы ZF знал что есть этот модуль и вызывал его при инициализации. При выводе 404 ошибки наверное есть сообщение что не так.