stigory

По первому вопросу у вас явное непонимание. LVM вас никак не избавит от необходимости наличия файловой системы. Он может упростить манипулирование файловыми системами. Но, в условиях домашней файлопомойки единственной востребованной функцией чаще всего становится расширение пространства хранения путем жонглирования (добавления-замены) физическими HDD-SSD носителями. Если вы не предполагаете в будущем роста количества дисков, то особенной выгоды от использования LVM вы не получите.

На остальные вопросы ответ вы уже получили. Для вашей основной хотелки оптимальнее использовать контейнеры. Но, если есть сильное желание повозиться с виртуализацией, то кто ж вам запретит.

Не хватает вводных данных. Есть ли AD, есть ли опыт работы с линуксовыми дистрибутивами? Какого размера среднестатистический файл в хранилище? Какая нагрузка планируется по обращениям к файлам, пропускной способности сети?
Просто посоветовать Debian - есть вероятность подложить свинью человеку. Чтобы SAMBA стала по настоящему быстрой придется над ней поработать. Иначе из коробки получится примерно 50-70Мб/с. Кого-то устроит, кому-то неприемлемо.
Файловые системы под линуксом тоже заставляют думать заранее. Одним хорошо много мелких файлов, другим подавай гигабайтные размеры.

Добавлю немного иной взгляд на этот вопрос. Все бубунты у меня внутри виртуалок. Бэкаплю виртуалки.