Виктор Таран

vi /etc/fstab

post_max_size
max_file_uploads
upload_max_filesize

ищется в гугле за 3 секунды
Если не получается то
phpinfo в студию
ну и логи

ISPConfig - если вы умеете делать 100% его функционала руками, значит вы не менеджер а как миниум очень и очень нехилый линукс администратор.
Чем он может быть полезен опытному пользователю
1. исключение человеческого фактора в кон фигах.
2. Ускорение работы, как бы вы быстро их не писали а кнопочку нажать быстрей.
3. При нескольких стоянях сайтов возникают разные требования которые должны выполнять как клиенты, так и менеджеры и тд и пт, посколкьу не все же вам делать.
4. Заменяемость вас, пока вас нет ( отпуск болезнь) люли могут делать все сами.
5. Наличие какого-никакого стандарта и АПИ.

Когда 3-5 сайтов может админка и не нужна.
Но когда их сотни то да она действительно нужна, или когда их нужно постоянно добавлять убавлять, работаь с записями ДНС, почтой фильтрами тд. Все же админка генерет достаточно много конфигов, и смысла писать их тупо нет.
6. Если же у вас есть знание и лишнее время ( а писать конфиги руками это оно и есть) и есть четкое понимание работы линукс.
ТО потратить их лучше на развитие самого проекта, дабы стать разрабом легко, а не тратиь свое время просто на самолюбование своей крутость.
Знаниями нужно делиться, дабы в панели есть че докрутить и доделать

Все очень просто.
1. Вы монтирутете себе на linux виндовую папку /var/www
Собственно и все

2 вариант используете openserver на винде ( если вы в линуксе плаваете то оно само то) https://ospanel.io/ для разработки тут инструментария за глаза, да и как полноценный веб сервер можно юзать.

3. Права на файлы, тут я вам дам пищу для размышлений
права это не644 а644 www-data: www:date или что-то вроде того ( там их на самом деле еще больше)
Не забывайте что
1группа отвечает за права админа
6--
2 групаа отвечает за права доверительных пользователей ( вошедщих в группу)
-4-
3 все остальные
--4
Следоватлеьно у вас и нет прав, посколку ваш юзен не вклчючен в группу www-data ( от которого работает апач) или от какого у вас там работает веб сервер. ( в текущей конфигурации это тоже не поможет посколкьу у доверительной группы тоже 4, а вот если было бы 774 то сработало бы ;)
Следоватлеьно что вам нужно сделать
chown -R www-data:www-data /var/www/site.ru/
В таком случае владелец будет веб сервер и попадать он будет в первую группу где у вас 6 а не 4
Ну или от обратного поменять юзера для апача на вашего.

вот еще для наглядности

В windows не было просо, да обычные права вы выставляли легко, но если я вам задам вопросы по владельцам и группами тд, то вы скорее всего засыпитесь.
В линуксе все права пишутся в одну строчку что очень удобно и понятно.
Ваша проблемма не в правах 755 и 777 а в том что вы не понимаете их до конца. Права это не только эти 3 цифры.
А так же еще и владелец и группа.
В вашем случае что происходит.
Вы как владелец попадаете в группу 1 и у вас права 7
А вот второй пользователь уже не попадает ни в группу "доверительных" а смело в последнюю, что в вашем случае уже не принципиально поскольку и там и там 5 5 соответственно.
Обратите внимание более внимательно на права файла.
777 root root вот права на файл, на самом деле там еще есть пара специфических прав но сейчас вам они будут не нужны
Владельца файла меняют через chown -R user:group /home/www/test.ru
НО УЧТИТЕ! их нужно менять очень внимательно поскольку если смените на системной папке то убьете ее!
По сути что вам нужно сделать
Выставлять качественные права 755 ибо 777 это костыль
В идиале вам для этого нужно чтоб юзер и группа совпадали и там и там, в таком случае вы попадете в 7 и там и тут.
Второй вариант 775 и добавить пользователя в доверительную группу.

Посмотрите тут все есть и владелец и группа https://sheensay.ru/wp-content/uploads/2015/06/ls-l.png