sed -i 's/ScriptAlias \/php-bin\/ \/var\/www\/php-bin\/user2\//новый текст/g' /etc/site-enabled/lalala.conf
sed -i 's/было/стало/g' файл
.*ScriptAlias .*
заменить на новую строку ^([^/]+{1,7})(\/|)$
-типа не слеш но любой символ от 1 до семи ну и слеш в конце если есть т отрезать ;)
Я вам ответил, RewriteBase это не то же самое что DocumentRoot и использовать его так нельзя !
Так же я вам ответил что вы через ж**пу используете denver и нужно не править .htaccess а правильно использовать инструмент.
В этом и есть ответ, я вам говорю не как сделать неправильное действие, а как его нужно сделать правильно, если же у вас есть причина для такой структуризации сайта то вы ее не указали.
Суть денвера эмуляция линукс, вы же пытаетесь на******ть на нем костылей приводя эту эмуляцию к полной бесполезности.