Интересный у вас стиль использования значков заземлений :)
На схеме регулятора один конец С4 висит в воздухе. Не хочу лезть в код, но все бы затворы полевиков, которые подключены к ардуине я бы приятнул к нулю резистором, чтобы не было неожиданных приколов.
Ток через светодиодик можно ограничить, даже не смотря на то, что оно коммутируется транзистором.
Шикарное именование разъемов и цепей. Около понижающего преобразователя есть разъем Vin, на который, как я понимаю, приходят ваши 36в, выходное напряжение Vout с этого преобразователя нигде не используется. На ардуино заведено Vin... При этом, на листе ардуины появилось +5В. Откуда оно взялось?
Сигнал Bat измеряет напряжение батареи чтоли через такой интересный делитель? Что-то я не уловил идеи, да еще и коммутируя его шимом.
Что-то думается мне, то, что на ваших макетках скорее всего мало похоже на то, что на схеме.
