script88

Только ROLLBACK http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/commit.html

Может стоит посмотреть в сторону партиций? dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/partitioning-pruning.html

Транзакция это 1 атомарная единица, то есть, либо у Вас 10к запросов типа INSERT выполнятся, либо нет. Для этого и была создана транзакция.

Если сервер не достаточно мощный + не оптимизированы как сам сервер так и БД, то это может привести к деградации системы.
Какой тип таблиц используете?

Ну как минимум можно развернуть еще 1 сервер приложений и 1 сервер mysql, в nginx upstreem подключаете app сервера (php-fpm), mysql настраиваете master-master тем самым нагрузка будет распределена между сервера.
На больших нагрузках советую использовать percona server вместо msyql,
П.С. по мимо серверной инфраструктуры надо заниматься оптимизацией и самого приложения.

Если Вам подойдет результат сравнения 2 таблиц, то можете установить maatkit (percona toolkit) и использовать из нее утилиту mk-sync-table
Это пример из моего скрипта для деплоя БД 2 серверов.
mk-table-sync --verbose --print --charset=$DB_CHARSET, h=$DBHOST_STAGE,P=$DBPORT_STAGE,u=$DBUSER_STAGE,p=$DBPASS_STAGE,t=$TABLE_LIST,D=$DBNAME_STAGE h=$DBHOST_PROD,P=$DBPORT_PROD,u=$DBUSER_PROD,p=$DBPASS_PROD,t=$TABLE_LIST,D=$DBNAME_PROD > $DIR_DB$DB_DATA_SQL

Попробуйте adminer 1 файл практически заменяет phpmyadmin, я думаю его куда легче заточить под свои нужны чем такого гиганта как pma

Если Вы явно не указываете блокировку, сервер сам ее выставит при select — read-lock при update — write-lock. В MyISAM блокируется вся таблица, в innoDB строка

Вот wiki.zmanda.com/index.php/MySQL_Backup_and_Recovery

А чем не устраивает создание пользователя в mysql и выставить ему привилегии только на SELECT ?!

Воспользуйтесь снепшотами, и перейдите на percona server.

1. Покажите конфиг MySQL,
2. Одним mysqltuner Вам не обойтись
3. Советую заменить MySQL на Perocona Server.

1 Конфиг в студию
2 Пробовали запрос в консоли выполнять?
3 Настроен ли кеш в мускуле?

paste.org.ru/?z2e4ud
P.S. по привычке нажал написать :)

Скриптец Вам в помощь