Решение:
Ставим FreeBSD 9.3 (возможно более старая версия тоже подойдет)
Скачиваем дистр php 5.3 с оф. сайта (в моем случае версия 5.3.27)
Конфигурировал я вот так
./configure --with-apxs2=/usr/local/sbin/apxs --prefix=/usr/local/php5 --enable-shared --enable-mbstring --with-curl --with-zlib --with-mcrypt --with-config-file-path=/usr/local/etc/php5
были ошибки что не найдены библиотеки curl, mcrypt.
Ставим их из портов и конфигурируем еще раз.
Все проходит успешно
Далее компилируем и устанавливаем
make && make install
Готово. Все нужные мне модули встали, CRM больше не возмущается и установка идет.
Надеюсь кому-нибудь пригодится.