rromm

Если видео смотреть, то можно использовать mkv с линкованием частей.
MKVToolNix умеет рубить файлы на куски и автоматически их линковать. Встроенный сплиттер MPC умеет такие файлы объединять при просмотре.
За скорость поиска не скажу, но открывать на воспроизведение может долго, если носитель не особо быстрый, а файлов много, потому что будет проверять все файлы в каталоге, чтобы таймлайн собрать.

Все просто.
Если кратко
compmgmt.msc->управление дисками->преобразовать диски в динамические если попросит ребутнуться, на не занятом диске правой кнопкой, там пункт добавить в зеркало, собственно все, займет столько же места сколько основной диск, если второй диск чуть больше то остальное место используйте на свое усмотрение, если хотите можно и загрузчика сделать также копию, действия те-же.