могу рекомендовать следующую методику:
1. разбить жесткий диск для установки системы и на раздел который будет в vmfs для esxi.
2. установить esxi на флешку, обьем в 4 Гб будет достаточно так как под саму систему используется не более 200 МБ остальное пойдет для дампов краша и остального.
3. Установить винду на оставшийся раздел.
4.
5. Profit.

на лету сделать невозможно. даже в случае использования VMware vCenter Converter, снимается образ с системы… а потом файлы можно смержить… но один фиг сетевые настройки надо перенастраивать.

вариант с акрониксом один из верных. но придется попатеть.главное чтобы это не домен контроллер был иначе сложнее все и критичнее.