Опишите пошагово, как вы создаёте расширение. Суть проблемы в каталоге в том, что система не может найти файл manifest.json, а не в том, что он неправильный. Причины могут быть две:

— Вы вручную упаковываете в архив папку с расширением, а не список файлов в этой папке (не должно быть вложенности)
— Вы упаковываете расширение через браузер, используя кириллические системные пути, например: Рабочий стол\myExtension\…, из-за этого архив может получиться битым (баг известный, есть даже в Хроме, мы его исправили, но пока не выпустили).

Решение: положите папку с расширением так: C:\myExtension\… и укажите эту папку в браузером упаковщике расширений.